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你好,我是 Logan

陈玥茏

博士生在读 at 香港中文大学

目前是在香港中文大学的生命科学学院博士生在读,已经是第三年了,按理说应该是最后一年,但是课题的进展并没有想象中的那么顺利。有的时候是因为的确不简单,有的时候呢确实因为自己并没有那么的抓紧时间。

领导力
合作
学习
阅读
运动
健康

技能

经历

1
博士研究生
香港中文大学

2019年8月 - Present, 香港

香港中文大学(The Chinese University of Hong Kong),简称港中大(CUHK),是一所亚洲顶尖、享誉国际的公立研究型综合大学,在人文学科、数学、计算机科学、经济与金融、医学、法律、传媒、地理等领域堪称世界级学术重镇,也是香港唯一有诺贝尔奖、菲尔兹奖、图灵奖及香农奖得主任教的大学。该校以“结合传统与现代,融会中国与西方”为使命,以书院制、中英兼重和多元文化为特色,是环太平洋大学联盟、世界大学联盟、松联盟、中国大学校长联谊会成员,亚洲首家AACSB认证成员,香港互联网交换中心所在地。(百度百科)

Responsibilities:
  • 生物信息
  • coding及non-coding RNA研究
  • RNA modification 研究
  • 三代测序, Nanopore

生物信息总监
深圳安吉康尔科技有限公司(现深圳雅济科技有限公司).

2018年5月 - 2019年7月, 深圳

雅济科技(Aegicare,原安吉康尔)总部位于深圳,并在硅谷设有研发中心,是以基因智能赋能罕见病诊断和药物研发的国家高新技术企业,核心团队来自Invitae、Myriad等美国医药产业界上市公司及CMU、UIUC、北京大学、清华大学等海内外顶级高校。公司基于前沿生物信息学、医学遗传学、高通量测序技术、功能基因组技术、人工智能与云计算技术,面向患者、医疗机构、科研机构和创新药企,开发世界领先的基因智能算法,解决影响全球数亿人口的罕见病相关信息的挖掘、翻译、解读、临床决策辅助和药物研发等问题。公司在深圳设立有1500㎡获卫健委批准的符合美国CLIA/CAP标准的深圳安吉康尔医学检验实验室,是中国妇幼保健协会唯一精准医疗会员单位,拥有美国医学遗传学会(ABMGG)资质认证,已与全国近300家三甲医院建立长期战略合作关系,并与北京大学工学院及华中科技大学同济医学院联合建立基因智能协同创新实验室,目前已积累十万级中国罕见病患者的全基因组和临床表型数据。(摘自官网)

Responsibilities:
  • 遗传病基因检测分析流程开发及维护
  • 组建分析流程开发团队
2

3
高级生物信息工程师
欧蒙医学诊断(中国)有限公司.

2018年2月 - 2018年5月, 北京

欧蒙医学诊断(中国)有限公司于1999年成立于北京,是欧蒙亚太集团总部。公司在中国、新加坡建立有先进的产品研发和生产基地,专业技术团队遍及中国多省市和地区(包括香港和台湾地区)以及韩国、新加坡、泰国等亚太国家。凭借提供高品质、全方位的医学诊断方案,秉承科技创新造就卓越品质,欧蒙诊断促进人类健康的企业宗旨,欧蒙的技术、产品与服务赢得了亚太地区客户的高度认可与信赖。(摘自官网)

Responsibilities:
  • 单基因遗传病检测流程开发

生物信息部主管
北京橡鑫生物科技有限公司.

2017年7月 - 2018年2月, 北京

橡鑫生物总部位于北京中关村国家自主创新示范区,在北京和天津拥有总面积达5000平方米的检测研发中心。公司专注于新一代基因组学在肿瘤精准医学的应用和产业化研究,是我国基因组行业的知名企业,已获得中关村高新技术企业、国家高新技术企业、第三方医学检验实验室、临床基因扩增检验实验室、国家科技型中小企业、2020中国科创企业百强等重要资质。(摘自官网)

Responsibilities:
  • 血液肿瘤分析流程开发维护
  • 血液肿瘤科研合作
  • 团队建设
4

5
生物信息部主管
安诺优达基因科技(北京)有限公司.

2015年7月 - 2017年6月, 北京

安诺优达基因科技成立于2012年,总部位于北京,在北京、义乌、上海设立医学检验实验室,是中国基因组行业的平台型企业。成立以来,安诺优达获得了国家高新技术企业、国家卫健委首批高通量基因测序技术临床应用试点单位、国家发改委首批基因检测技术应用示范中心、国家级“专精特新”小巨人企业、精准医疗与基因工程北京市工程实验室、北京市知识产权示范单位、中关村前沿技术企业、北京企业技术中心创新服务联盟会员单位等多项资质荣誉,拥有博士后科研工作站,入选中国最具科技引领力企业30强、中国最具投资价值企业50强、中国基因科技企业TOP10。(摘自官网)

Responsibilities:
  • 血液肿瘤分析流程开发维护
  • 血液肿瘤科研合作
  • 团队建设

项目

Kubernetes
Contributor March 2018 - Present

Production-Grade Container Scheduling and Management.

Tensorflow
Developer Jun 2018 - Present

An Open Source Machine Learning Framework for Everyone.

Toha
Owner Jun 2019 - Present

A Hugo theme for personal portfolio.

最近发布

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Chapter 2 Methods in Molecular Biology and Genetic Engineering

Create Time: 2022-06-24 Update Time: 2022-06-27 2.1 Introduction 我们的生命科学研究离不开工具的辅佐,这一章主要介绍了一些相关的分子生物学研究方法,其中包含了非常重要的两类: 限制性内切酶(restriction endonucleases) 克隆载体(cloning vectors) 随着发展,我们已经进入到了可以在全基因组层面研究功能和表达了。所以这章将介绍一些起源工具及一些最近的工具。 2.2 Nucleases Nucleases能水解磷酸二酯键中的酯 Phosphatases只能水解磷酸单酯键中的酯 Phosphatase也是很重要的,尽管它只能水解末端的磷酸酯键,这样它就能去掉末端的磷酸盐,这样的作用可以用于连接多条链(ligating or connecting chains)。也可以用来使用32P来做标记。 Nucleases可以分成两类: 外切酶(exonuclease):只能从链的末尾开始水解 内切酶(endonuclease):可以从链的中间开始水解 不同的nucleases的targets也不同,例如有针对DNA的也有针对RNA的,有针对单链的也有针对双链的,还有针对于DNA/RNA hybrid的(例如:RNaseH,在lib prep中最常用到的,至少对我来说)。而且不同的nuclease可能还有序列的偏好,例如pancreatic RNase A,就偏好于在pyrimidine(C,T)后切。这种有很强的序列特异性的,我们就叫做限制性内切酶(restriction enzyme)。 限制性内切酶也有三种分类: Type I:剪切的位点与识别的位点相差1000bp Type II:序列的识别与剪切位点相同,换句话说就是剪切识别位点。这类特异性序列是回文的(inversely palindromic) Type III:剪切的位点与识别的位点相差20-30bp 剪切完后的末端可能形成两种,一种是staggered,一种是blunt。来源不同的限制性内切酶如果识别的位点相同,但是也可能产生不同的剪切结果,主要是产生的末端可能有差异,这样的限制性内切酶集合叫做isoschizomers。 When a DNA molecule is cut with a suitable restriction enzyme, it is cleaved into distinct, negatively charged fragments.

成就

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